DUNE: PROPHECY beobachtet zwei Harkonnen-Schwestern bei ihrem Kampf gegen Mächte, die die Zukunft der Menschheit bedrohen. Sie gründen die sagenhafte Sekte, die als Bene Gesserit bekannt wird. DUNE: PROPHECY basiert auf dem Roman DER THRON DES WÜSTENPLANETEN von Brian Herbert und Kevin J. Anderson.